Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Htr1fQ02284 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms