Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms