Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms