Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms