Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uba1Q02053 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba1Q02053 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms