Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
RykQ01887 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RykQ01887 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RykQ01887 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RykQ01887 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RykQ01887 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms