Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms