Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Top2aQ01320 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms