Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yy1Q00899 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yy1Q00899 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yy1Q00899 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms