Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms