Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabpb1Q00420 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms