Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms