Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp10Q000W5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms