Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc1P98083 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc1P98083 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc1P98083 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms