Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn1bP97952 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms