Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama4P97927 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama4P97927 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama4P97927 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama4P97927 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama4P97927 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama4P97927 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama4P97927 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama4P97927 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama4P97927 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama4P97927 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama4P97927 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama4P97927 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms