Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp6P97868 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp6P97868 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms