Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smn1P97801 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms