Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AlkP97793 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AlkP97793 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AlkP97793 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AlkP97793 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AlkP97793 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AlkP97793 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AlkP97793 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AlkP97793 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AlkP97793 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AlkP97793 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AlkP97793 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AlkP97793 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AlkP97793 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AlkP97793 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AlkP97793 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AlkP97793 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AlkP97793 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
AlkP97793 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlkP97793 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlkP97793 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlkP97793 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlkP97793 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlkP97793 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlkP97793 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlkP97793 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlkP97793 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AlkP97793 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AlkP97793 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AlkP97793 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AlkP97793 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AlkP97793 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AlkP97793 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AlkP97793 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AlkP97793 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
AlkP97793 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AlkP97793 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AlkP97793 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AlkP97793 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AlkP97793 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AlkP97793 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AlkP97793 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
AlkP97793 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AlkP97793 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AlkP97793 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AlkP97793 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlkP97793 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlkP97793 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlkP97793 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
AlkP97793 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlkP97793 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlkP97793 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlkP97793 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlkP97793 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AlkP97793 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AlkP97793 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AlkP97793 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AlkP97793 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AlkP97793 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AlkP97793 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AlkP97793 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
AlkP97793 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AlkP97793 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AlkP97793 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AlkP97793 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AlkP97793 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AlkP97793 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AlkP97793 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AlkP97793 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AlkP97793 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AlkP97793 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AlkP97793 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
AlkP97793 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AlkP97793 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AlkP97793 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AlkP97793 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AlkP97793 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AlkP97793 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AlkP97793 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AlkP97793 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
AlkP97793 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AlkP97793 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms