Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cited1P97769 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cited1P97769 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms