Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms