Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx3-1P97436 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms