Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp1b3P97370 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms