Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp1P97350 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms