Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-3P97334 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-3P97334 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms