Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms