Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3f3aP84244 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms