Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Arf1P84078 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Arf1P84078 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arf1P84078 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arf1P84078 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Arf1P84078 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Arf1P84078 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Arf1P84078 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Arf1P84078 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arf1P84078 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms