Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HpcaP84075 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HpcaP84075 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HpcaP84075 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HpcaP84075 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HpcaP84075 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HpcaP84075 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HpcaP84075 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HpcaP84075 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HpcaP84075 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms