Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElocP83940 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElocP83940 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElocP83940 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElocP83940 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElocP83940 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ElocP83940 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ElocP83940 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElocP83940 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElocP83940 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElocP83940 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElocP83940 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ElocP83940 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ElocP83940 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ElocP83940 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ElocP83940 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ElocP83940 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ElocP83940 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ElocP83940 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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