Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprn2P80560 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprn2P80560 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms