Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms