Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctps1P70698 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctps1P70698 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms