Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp9xP70398 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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