Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad1P70340 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad1P70340 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad1P70340 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms