Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms