Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux2P70298 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux2P70298 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cux2P70298 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux2P70298 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cux2P70298 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cux2P70298 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cux2P70298 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux2P70298 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux2P70298 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms