Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd13P70217 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms