Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barhl1P63157 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms