Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabrb3P63080 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms