Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps3P62908 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps3P62908 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3P62908 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps3P62908 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3P62908 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms