Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms