Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbpl1P62340 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms