Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms