Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp46P62069 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp46P62069 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Usp46P62069 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Usp46P62069 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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Usp46P62069 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp46P62069 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp46P62069 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp46P62069 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp46P62069 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp46P62069 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp46P62069 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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