Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmo4P61969 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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