Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5r1P61809 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms