Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Depdc5P61460 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Depdc5P61460 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Depdc5P61460 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms