Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smg6P61406 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg6P61406 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg6P61406 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg6P61406 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg6P61406 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms