Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl27P61358 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl27P61358 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms